Personal Genomics

🧬 本地 DNA 分析,隐私零泄露

1600+基因标记本地隐私分析,涵盖用药安全、癌症风险、祖源追溯等30类健康洞察,数据零上传。

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使用说明

核心用法

Personal Genomics Skill 是一款面向 AI 代理的本地化基因组分析工具,支持解析 23andMe、AncestryDNA、MyHeritage 等消费级基因检测数据,以及 VCF 格式的全基因组/外显子组数据。用户通过 Python 命令行或模块调用即可启动分析,输出包括 AI 优化的摘要(agent_summary.json)、完整数据(full_analysis.json)、人类可读报告(report.txt)及专业 PDF 文档。

分析涵盖 1600+ 基因标记,分为 21 大类别:药物基因组学(159)、多基因风险评分(277)、携带者状态(181)、健康风险(233)、祖源成分(124)、遗传性癌症(41)、自身免疫 HLA(31)、疼痛敏感性(20)、睡眠优化、运动表现、UV 敏感性、端粒长度等。v4.1.0 新增药物相互作用检查器、睡眠优化档案、饮食互作矩阵、运动表现档案等功能模块。

显著优点

1. 隐私优先设计:所有分析本地运行,零网络请求,数据不出设备,适合敏感健康信息处理。
2. 医学级覆盖:整合 CPIC 指南、FDA 警告、PubMed 文献,提供致命毒性风险(如 DPYD、HLA-B*5701)等关键警报。

3. 多场景输出:支持 AI 代理消费(agent_summary.json)、医生共享 PDF、遗传咨询师导出格式,甚至 Apple Health 兼容数据。

4. 自然语言解释:将 rsID 基因型转化为通俗说明,降低专业门槛。

5. 祖源与谱系:线粒体 DNA 母系溯源、Y 染色体父系溯源(男性),符合 PhyloTree/ISOGG 标准。

潜在缺点与局限性

  • 数据不完整:消费级芯片仅覆盖 ~0.1% 基因组,罕见变异检测受限;阴性结果不能排除疾病综合征。
  • 概率非确定性:大多数疾病遗传度仅 50-80%,结果不代表医学诊断。
  • 单倍群分辨率:无全基因组测序时,单倍群细分精度不足。
  • 用户心理负担:高遗传风险(如 APOE ε4/ε4 的 12 倍阿尔茨海默风险)可能引发显著焦虑,需建议遗传咨询。
  • 监管灰色地带:直接面向消费者的基因健康解读在部分司法辖区受限。

适合人群

  • 已有 DTC 基因数据、关注隐私的技术用户
  • 希望了解药物代谢特征以辅助用药决策者
  • 有家族癌症史、需初步遗传性癌症筛查者
  • 运动员/健身爱好者寻求个性化训练建议
  • 对祖源、谱系追溯感兴趣的基因爱好者

常规风险

  • 误读风险:用户可能过度解读多基因风险评分,忽视环境/生活方式因素。
  • 医疗延误:自我诊断导致延迟就医,工具明确建议"咨询医疗提供者"。
  • 家庭关系冲击:非亲子预期、携带者状态可能引发家庭伦理问题。
  • 数据安全:虽本地运行,但原始 DNA 文件若未加密存储仍有泄露风险。

Personal Genomics 内容

markers文件夹
references文件夹
snp_databases文件夹
tests文件夹
fixtures文件夹
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__init__.pytext/plain
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