Clinical Data Cleaner

🧬 临床试验数据标准化与合规清洗

专业级临床数据清洗工具,支持CDISC SDTM标准化与FDA/EMA合规审计,适用于临床试验数据治理与监管申报准备

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使用说明

核心功能

Clinical Data Cleaner 是一款面向生物医药行业的专业数据治理工具,专为临床试验数据的清洗、验证与标准化设计。该工具深度集成CDISC SDTM标准,支持DM(人口学)、LB(实验室检查)、VS(生命体征)等核心域的数据处理,可直接输出符合FDA、EMA监管要求的格式化数据集与完整审计追踪报告。

显著优势

  • 监管合规性:内置CDISC SDTM实施指南验证逻辑,自动生成JSON格式审计轨迹,满足21 CFR Part 11等法规要求
  • 临床专业阈值:针对血糖、血红蛋白、血压等关键指标预设临床合理范围,支持IQR、Z-score及域专属三种异常值检测策略
  • 灵活缺失值处理:提供均值、中位数、众数、前向填充及删除等多种插补策略,适配不同分析场景
  • 标准化管道:一键完成日期格式转换(ISO 8601)、编码统一、域验证等全流程操作
  • 双模交互:同时提供Python API与命令行接口,便于集成至现有数据管道或即席分析

潜在局限

  • 域覆盖有限:当前仅支持DM、LB、VS三个核心域,AE(不良事件)、CM(合并用药)等关键域尚未纳入
  • 阈值静态化:临床阈值以硬编码JSON形式存在,未开放用户自定义接口,罕见疾病或特殊人群研究可能需手动调整
  • 算法透明度:中位数插补、IQR计算等统计方法的实现细节未在文档中充分披露,可能影响学术发表时的方法学描述
  • 依赖外部验证:SDTM符合性检查依赖本地JSON规范文件,若CDISC标准更新可能导致验证滞后

适用人群

  • 临床试验数据管理员(DM)
  • 生物统计师与编程分析师
  • CRO(合同研究组织)数据标准化团队
  • 药企监管事务部门

常规风险

  • 数据完整性风险:缺失值删除策略可能导致样本量不足,影响统计效能
  • 异常值误判:临床阈值基于一般人群设定,极端值标记需结合医学判断复核
  • 审计轨迹缺失:若未正确调用save_report(),关键清洗操作将无法追溯
  • 版本兼容性:SDTM IG版本迭代时需及时更新domain_specs.json,否则可能产生合规偏差

Clinical Data Cleaner 内容

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